تُعدّ مكتبة كلية ميرتون (في كلية ميرتون، أكسفورد ) من أقدم المكتبات في إنجلترا، وهي إحدى أقدم المكتبات الأكاديمية في العالم التي لا تزال تُستخدم يوميًا. تتوزع المكتبة في عدة أجزاء من الكلية، وفيها مجموعة قيّمة من الكتب القديمة المطبوعة وأكثر من 300 مخطوطة تعود للعصور الوسطى. جُمعت هذه المجموعة التاريخية في البداية من خلال التبرعات، بما في ذلك مخطوطات تبرّع بها رجل الدين ويليام ريد. تضم المكتبة كتباً مطبوعة قديمة من المكتبات الشخصية تبرع بها غريفين هيغز وهنري كينت، اللّذَين تبرّعا في الأصل بحوالي 600 و800 مجلد على التوالي. ويبلغ عدد المجلدات في المجموعة الرئيسية حوالي 70,000 مجلد.
تقع المكتبة العليا في الطابق الأول من صفين متعامدين من المباني التي بناها ويليام همبرفيل حوالي عام 1373 ضمن عملية إكمال ساحة موب، وهي الجزء الأقدم من المكتبة وواحدة من أوائل الساحات الجامعية.
خضعت المكتبة العلوية لتحسينات في القرن السادس عشر تحت إدارة السير هنري سافيل. أُضيفت نوافذ كبيرة إلى السقف لإدخال المزيد من الضوء، وأعاد توماس بودلي تنظيمها على الطراز القاري الجديد؛ حيث استُبدلت خزائن الكتب القديمة ومنصات القراءة بأرفف كتب - كانت من أوائل الأرفف المستخدمة في إنجلترا - مع مقاعد بينها. ولا تزال المكتبة العلوية تحتفظ بهذه التجهيزات التي تعود إلى القرن السادس عشر.
تحوي المكتبة عددًا من خزائن الكتب، وبعض الكتب المربوطة بسلاسل، ونسخة من الكتاب المقدس الويلزي للملكة إليزابيث الأولى، وزوجًا متطابقًا من مجسمات الكرة الأرضية من القرن السادس عشر (أحدهما للأرض والآخر للسماء)، ومجموعة من الأسطرلابات وغيرها من الأدوات العلمية القديمة. وعلى الرغم من أن المكتبة الأكاديمية الرئيسية موجودة في مكان آخر، إلا أن أعضاء الكلية لا يزالون يستخدمون المكتبة العليا بانتظام، وهي مفتوحة للزوار بالتنسيق المسبق. كما تضمّ المكتبة مجموعات مهمة من الأوراق والمخطوطات لثلاثة من خريجي كلية ميرتون: متسلق الجبال أندرو "ساندي" إيرفين، والكاتبين تي إس إليوت وماكس بيربوم.
ذُكرت المكتبة في رواية غاتسبي العظيم التي كتبها المؤلف الأمريكي إف. سكوت فيتزجيرالد عام 1925، حيث يدعي المليونير الشاب والغامض جاي غاتسبي أنه "رجل أكسفورد".
كانت مكتبة كلية ميرتون رائدة في وضع الكتب في وضع رأسي بدلاً من الوضع الأفقي.