مقاطعة مايوت هي منطقة إدارية تابعة لولاية أعالي النيل في منطقة أعالي النيل الكبرى بجنوب السودان. تحدها مقاطعة ناصر من الغرب، ومقاطعة لونجيتشوك من الشمال، وإثيوبيا من الشرق والجنوب.
في استفتاء استقلال جنوب السودان، حققت مقاطعة مايوت إنجازاً تاريخياً حيث صوت جميع سكانها المسجلين بنسبة 100% لصالح انفصال جنوب السودان.
مدير منطقة مايوت هو ثينج ستيفان ريت.