معركة بوغوينو (بالبوسنوية: Bitka za Bugojno) دارت بين قوات جيش جمهورية البوسنة والهرسك ومجلس الدفاع الكرواتي للسيطرة على بلدة وبلدية بوغوينو في وسط البوسنة والهرسك من 18 إلى 28 يوليو 1993. كانت منطقة بوغوينو تحت السيطرة المشتركة للواء 307 التابع لجيش جمهورية البوسنة والهرسك ولواء يوجين كفاتيرنيك التابع لمجلس الدفاع الكرواتي منذ بداية حرب البوسنة والهرسك. وقعت أحداث عنف في بوغوينو في أعقاب تصعيد الحرب الكرواتية البوسنية في البلديات المجاورة طوال النصف الأول من عام 1993. وقد نجت بوغوينو من القتال وكان اللواءان المحليان لا يزالان متحالفين رسميا بحلول يونيو 1993 في وقت هجوم جيش جمهورية البوسنة والهرسك في وسط البوسنة والهرسك.
اندلع القتال في المدينة في 18 يوليو. تم فصل قوات مجلس الدفاع الكرواتي التي تجاوز عددها بثلاثة إلى واحد وتم تطويقها في عدة مواقع. تم هزيمة معظمهم في غضون أسبوع من القتال المكثف في الشوارع. استسلمت آخر وحدات مجلس الدفاع الكرواتي في البلدة في 25 يوليو بينما استمر القتال في بقية البلدية لمدة أربعة أيام أخرى. فاز جيش جمهورية البوسنة والهرسك بالسيطرة على البلدية بأكملها. كانت خسائر جيش جمهورية البوسنة والهرسك 92 قتيل و 211 جريح في حين أن مجلس الدفاع الكرواتي قتل منه 107 وجرح 130 وأسر 470. تم تدمير لواء يوجين كفاتيرنيك بشكل فعال في المعركة وفر ما يقدر بنحو 15000 من الكرواتيين. تم اعتقال عدة مئات من أسرى الحرب من مجلس الدفاع الكرواتي والمدنيين في العديد من معسكرات الاعتقال في المدينة بما في ذلك ملعب إسكرا. أطلق سراح آخر السجناء في مارس 1994.
أدانت محكمة البوسنة والهرسك أربعة من مسؤولي جيش جمهورية البوسنة والهرسك ومسؤول واحد في مجلس الدفاع الكرواتي بارتكاب جرائم حرب أثناء المعركة وبعدها. اتهمت المحكمة سلطات جيش جمهورية البوسنة والهرسك في بوغوينو بالمشاركة في عمل إجرامي مشترك ضد المعتقلين الكروات وهو حكم تم إسقاطه عند الاستئناف.