مسجد الضحى يقع في حي الصليبة القديم، ويقع بين أبنية غلب عليها البناء المعماري القديم، فالحجارة والأزقة والجدران العالية تحيط بالمسجد القديم. ويقع إلى الغرب من أعمدة باخوس مقابل جامع ياسين القديم والذي أعيد ترميمه عام 2011، وقريباً من حديقة أبي تمام، يعتقد بأنه البناء الذي قصده ابن بطلان بقوله: "فيها بيت كان للأصنام وهو اليوم كنيسة وكان في أول الإسلام مسجداً"، (والمقصود بكلمة فيها أي مدينة اللاذقية)، وأن وجود القبة على البناء جعل الناس يطلقون عليه اسم مسجد القبة.
أصل مسجد القبَّة (قبَّة الداويَّة) في حي الأشرفـيَّة بالصليبة :
أصلُ البناء مُصلَّىً لـِ (مطران اللاذقـيَّة اللاتينيّ) وفرسان الداويَّة (فرسان المعبد أو الهيكل) في زمن الحروب الصليبية، حوَّلهُ السُّلطانُ (الناصرُ صلاحُ الدين الأيُّوبيّ) إلى مكتبٍ إسلاميٍّ في سنة 584هـ (1188م).
وأنشأهُ مسجداً الحاج (علي بن عبد الرحمن الشهير بابن العجَّان العكَّاريّ) في سنة 1122هـ (1710م).
يُعرف اليوم بـِ (جامع الضحى) إذ رُمِّم على نفقة السيِّدة (ضحى قنِّيش) وافتُتح في 4 رجب 1425هـ (19 آب 2004م).
المسجد اليوم بات يدعى مسجد الضحى حسب اللوحة الحجرية التي تعلو بابه الشرقي الرئيسي، بينما بقي مسماه الشعبي شائعاً بمسجد القبة الخضراء نسبة لقبته الصغيرة الوحيدة التي تتوسط سقفه.