مجزرة خوجالي (بالأذرية:Xocalı soyqırımı) هي عملية عسكرية قامت بها فرقة من الجيش الأرمني في 25-26 فبراير 1992 خلال حرب ناغورنو كرباخ راح ضحيتها بحسب مصادر حكومية أذرية حوالي 613 مدني أذري.
إبادة جماعية خوجالي هي واحدة من المآسي الرهيبة التي تواجه الشعب الأذربيجاني في القرن العشرين.
في المصادر الأذربيجانية، تسمى هذه الأحداث مأساة خوجالي أو إبادة خوجالي.