مدينة الشيخ خليفة (بالإنجليزية: Sheikh Khalifa City) مدينة سكنية تقع في جنوب قطاع غزة، في منطقة رفح، بين رفح وخان يونس. أُعلن عن إنشائها سنة 2005 بتمويل من رئيس دولة الإمارات العربية المتحدة الشيخ خليفة بن زايد آل نهيان، لإقامة مشروع إسكاني يضم نحو 3,000 وحدة سكنية للأسر الفلسطينية.
أقيم المشروع على أراضٍ كانت تقوم عليها مستوطنة موراغ الإسرائيلية السابقة، ضمن تجمع غوش قطيف، بعد إخلائها في إطار خطة فك الارتباط الإسرائيلية أحادية الجانب عن قطاع غزة سنة 2005.