مخطوطات تمبكتو هي مجموعة من المخطوطات تصل إلى 700,000 مخطوطة اكثرها باللغة العربية أو بلغات محلية كتبت بالحروف العربية موجوة في تمبكتو. بسبب الاحتلال الفرنسي فان أغلب المتعلمين في مالي يدرسون بالفرنسية ولا يجيدون العربية فبالتالى تم تجاهل المخطوطات من قبل الشريحة المتعلمة في البلد.
أغلب المخطوطات في وضع مزري ومهدده من العواصف الرملية والنمل الأبيض.