محمد أيوب خان هو أمير أفغانستان من 1879م إلى 1880 م.
هو محمد أيوب خان بن شير علي خان بن دوست محمد خان تولى إمارة أفغانستان عام 1879م . يعرف أيضا بلقب الغازي، وكان أيضا زعيم الأفغان في الحرب الإنجليزية الأفغانية الثانية . وهو يتذكر اليوم كبطل قومي لأفغانستان . خلع أخاه محمد يعقوب خان بسبب رغبة محمد يعقوب خان التنازل عن شؤون أفغانستان الخارجية لمصلحة بريطانيا .وتوفي عام 1914 م ودفن في بيشاور .