محطة طوكيو (باليابانية: 東京駅، بالروماجي: Tōkyō-eki) هي محطة قطار تقع في حي تشيودا من مدينة طوكيو، بالقرب من قصر طوكيو الإمبراطوري و حي غينزا التجاري.
هي المحطة النهائية الرئيسية في طوكيو للخطوط بين المدن، وأكثر المحطات ازدحاما في اليابان من ناحية عدد القطارات يوميا (أكثر من 3000) و الثامن من ناحية عدد المسافرين. محطة طوكيو هي نقطة انطلاق ووصول أغلب قطارات الشينكانسن و تصلها العديد من الخطوط المحلية والإقليمية لسكك حديد اليابان و هي مربوطة بشبكة مترو أنفاق طوكيو.