متحف التاريخ الطبيعي هو أحد أهم المتاحف في سلطنة عمان. يقع متحف التاريخ الطبيعي في ولاية بوشر، تحديداً في منطقة الخوير بنفس مبنى وزارة التراث والثقافة.
تم افتتاح متحف التاريخ الطبيعي عام 1985، ويضم عدة أجنحة وأقسام متنوعة منها ما يحكي التاريخ الطبيعي البحري لسلطنة عمان ومنها ما تحكي قصص الكائنات البرية التي عاشت في السلطنة وبقايا لأحجار ونباتتات وكائنات متحجرة.
تضم هذه الأقسام بين جنباتها كنوزاً طبيعية تتنوع بين كائنات برية وبحرية ومعالم أخرى طبيعية ومنها بقايا مرجان متحجر عثر عليه في منطقة وادي السحتن في ولاية الرستاق في جنوب محافظة الباطنة شمال السلطنة، ويقدر عمرها بأكثر من 270 مليون سنة.كما يضم المتحف بقايا لمعادن وأشجار متحجرة وعظام لكائنات عاشت في عُمان.