لين مارغوليس (الإنجليزية: Lynn Margulis) (م:5 مارس 1938-و:22 نوفمبر 2011) عالمة أحياء أمريكية وأستاذة في جامعة ماساتشوستس قسم علوم الأرض
اشتهرت بنظرية أصل العضيات حقيقية النواة(الإنجليزية: the origin of eukaryotic organelles,)، وأيضا مساهمتها في نظرية التكافل الداخلي (الإنجليزية: endosymbiotic theory)