كهوف قمران هي سلسلة من الكهوف، بعضها طبيعي وبعضها اصطناعي، وجدت حول موقع خربة قمران الأثري في صحراء يهودا بالضفة الغربية. وقد اكتشفت مخطوطات البحر الميت في هذه الكهوف.
استولت هيئة الطبيعة والحدائق الإسرائيلية على الموقع بعد نهاية حرب عام 1967، عندما احتلت إسرائيل الضفة الغربية واستولت على خربة قمران. استثمرت إسرائيل منذ ذلك الحين بكثافة في المنطقة لإنشاء كهوف قمران كموقع «للتراث اليهودي الإسرائيلي الفريد». الكهوف معترف بها في إسرائيل كموقع للتراث الوطني، على الرغم من وجود الكهوف في الأراضي الفلسطينية المحتلة. مما آثار إنتقادات على هذا التصنيف.