كنيسة مار إليان كنيسة أثرية قديمة تقع في حمص وسط سوريا، بإشراف أبرشية حمص ضمن بطريركية أنطاكية وسائر المشرق للروم الأرثوذكس، وهي تحوي رفات القديس إليان الحمصي، القديس المسيحي الذي قتل خلال الاضطهادات الرومانية في القرن الثالث. تقع الكنيسة في شارع طرفة بن العبد بالقرب من بوابة تدمر داخل حمص القديمة، ويقام عيد القديس إليان سنويًا في 6 فبراير وهو ما يجذب عددًا كبيرًا من الحجاج.
يقام في الكنيسة سنويًا وبالتعاون مع مجلس مدينة حمص «أسبوع مار إليان الثقافي».