البابا كليمنت الثاني ((باللاتينية: Clemens II); ولد سيدغير فون مورسليبين؛ توفي 9 أكتوبر 1047)، كان البابا من 25 كانون الأول / ديسمبر 1046 حتى وفاته عام 1047. كان الأول في سلسلة من الباباوات الإصلاحيين ألألمان.
سيدغير كان أسقف مدينة بامبرغ. في 1046، رافق هنري ملك ألمانيا، عندما توجه بطلب من علمانيي ورجال الدين روما هنري ذهب إلى إيطاليا ووألف مجلس أستري الذي خلع الباباوات بنديكت التاسع وسيلفستر الثالث، وقبل استقالة غريغوري السادس. ثم اقترح هنري ترشيح سيدغر للباباوية. وعندما انتخب أتخذ اسم كليمنت الثاني. قام كليمنت بتتويج هنري كإمبراطور روماني مقدس.
شهدت فترة كليمنت الوجيزة سنن صارمة في حظر الرشوة.