كلية الهندسة بجامعة الخرطوم تم تأسيسها في العام 1939 م. رسالة كلية الهندسة مكملة وداعمة لرسالة جامعة الخرطوم، التي تركز علي الريادة في أكتشاف وتطبيق المعرفة ونشرها من خلال التدريب والبحوث وخدمة المجتمع.
انسجاما مع رسالة جامعة الخرطوم تهدف كلية الهندسة لتقديم برامج تعليمية عالية الجودة من أجل تأهيل الدارسين في المجالات الهندسية المختلفة وإعدادهم للمساهمة في تحقيق التنمية الاقتصادية والاجتماعية للمجتمع السوداني.