كلية الهندسة الخوارزمي في جامعة بغداد هي كلية تعنى بدراسة العلوم الهندسية الحديثة وكانت تعرف ب الهندسة الثانية في جامعة بغداد. سميت بعد الحرب الأخيرة على العراق بهندسة الخوارزمي تيمنا بعالم الرياضيات المعروف الخوارزمي. مقرها في منطقة الجادرية في بغداد.
تأسست في 13 حزيران 2002، الدفعة الأولى للطلابِ أُدخلتْ إلى الكليَّةِ في بدءِ السنة الدراسيةِ 2002-2003 بعد إنْجاز كُلّ متطلبات كليَّةِ بضمن ذلك البناياتِ والمختبراتِ بتنسيقِ جامعةِ بغداد. وتعنى بدارسة فروع الهندسة الحديثة وقد باسم الهندسة الثانية وكانت تابعة للهندسة الأولى وهي الرئيسية في جامعة بغداد، كانت الدراسة فيها تبدأ من الصف الثالث ويتم القبول فيها بعد الخضوع للامتحان التأهيلي. لكنها الآن تبدأ الدراسة فيها من الصف الأول عن طريق القبول المركزي الذي يتم بعد أكمال الطلاب لمرحلة الثانوية.