تأسست كلية الطب في جامعة بابل في العام 1993 في بناية داخل الحرم الجامعي المركزي ثم تم بناء بناية جديدة لها في منطقة الإسكان في الحلة بالقرب من مستشفى الحلة الجراحي، وتم تحويل المستشفيات الرئيسية الثلاث في الحلة إلى مستشفيات تعليمية وهي:
1- مستشفى مرجان التعليمي للامراض الباطنية والصدرية
2- مستشفى الحلة الجراحي التعليمي
3- مستشفى بابل للنسائية والاطفال التعليمي