تُدار رياضة كرة القدم في جزر كوك بواسطة اتحاد جزر كوك لكرة القدم، وهو عضو كامل في اتحاد أوقيانوسيا لكرة القدم والاتحاد الدولي لكرة القدم. يدير الاتحاد المنتخب الوطني، ويضم 13 عضوًا كاملًا من أندية كرة القدم، منها 6 أندية في جزيرة راروتونغا: نادي أفاتيو، ونادي ماتافيرا–نغاتانغيا، ونادي نيكاو سوكاتاك، ونادي بوايكورا، ونادي تيتيكافيكا، ونادي توبابا مارايرينغا. كما يشمل الاتحاد 7 اتحادات جزرية: آيتوتاكي، أيتيو، مانغايا، ماوكي، ميتيارو، بوكابوكا، راكاهانغا، إضافة إلى 3 أعضاء منتسبين: مانيهيكي، ناسو، وبنراين.