واجهت شركة كاسبرسكي لاب جدلاً واسع النطاق بسبب مزاعم تفيد بأنها تعاونت مع جهاز الأمن الفيدرالي الروسي لاستخدام برامجها لمسح أجهزة الكمبيوتر في جميع أنحاء العالم بحثًا عن مواد ذات أهمية - وهي العلاقات التي نفتها الشركة بشدة. حظرت وزارة الأمن الداخلي الأمريكية منتجات كاسبرسكي في جميع الإدارات الحكومية في 13 سبتمبر 2017، زاعمة أن شركة كاسبرسكي لاب عملت على مشاريع سرية مع جهاز الأمن الفيدرالي الروسي. في أكتوبر/تشرين الأول 2017، زعمت تقارير لاحقة أن قراصنة يعملون لصالح الحكومة الروسية سرقوا بيانات سرية من جهاز كمبيوتر منزلي لمتعاقد مع وكالة الأمن القومي في عام 2015 عبر برنامج كاسبيرسكي لمكافحة الفيروسات. ونفت كاسبرسكي هذه الاتهامات، مؤكدة أن البرنامج اكتشف عينات من البرامج الضارة لمجموعة إكويشن، وقام بتحميلها إلى خوادمها للتحليل في سياق عملها الطبيعي.
وأعلنت الشركة منذ ذلك الحين عن التزاماتها بتعزيز المساءلة، مثل طلب المراجعات المستقلة والتحقق من الكود المصدر لبرمجياتها، والإعلان عن أنها ستنقل بعض البنية التحتية الأساسية لعملاء أجانب مختارين من روسيا إلى سويسرا. وقد أثيرت مزاعم الارتباط بالحكومة الروسية مرة أخرى مع رد فعل الشركة المثير للجدل على الغزو الروسي لأوكرانيا في عام 2022.