كأس الاتحاد الإفريقي 2000 هي النسخة التاسعة من كأس الاتحاد الإفريقي ، مسابقة الأندية الإفريقية القارية للوصيفين في الدوريات المحلية. وفاز باللقب نادي شبيبة القبائل الجزائري الذي تغلب على نادي الإسماعيلي المصري بقاعدة الأهداف خارج الأرض في المباراة النهائية بعد أن حل التعادل في مجموع المباراتين 1-1.
وهي البطولة القارية الثالثة للاتحاد الإفريقي لكرة القدم