كأس الأمم الإفريقية 1988 هي النسخة السادسة عشرة من كأس الأمم الإفريقية، التي تقام برعاية الاتحاد الإفريقي لكرة القدم. استضافها المغرب الذي حل محل المضيف الأصلي زامبيا. على غرار نسخة 1986، قسمت الفرق المشاركة الثمانية إلى مجموعتين تضم كل واحدة منهما أربعة فرق. أقيمت المباراة النهائية للبطولة في الدار البيضاء على ملعب محمد الخامس وفازت الكاميرون بلقبها الثاني بفوزها على نيجيريا في المبارة النهائية 1-0.
سجل في هذه البطولة أقل معدل أهداف لكل مباراة في بطولات كأس الأمم الإفريقية.