قناة إتاباكا (بالإسبانية:Canal de Itabaca
)هي قناة تقع في جزر غالاباغوس في الإكوادور. تفصل هذه القناة بين بالترا وجزيرة سانتا كروز. تعبر هذه القناة بعض السفن المائية التي تنقل الركاب من جزيرة بالترا (جنوب سيمور) في الشمال، حيث يوجد مطار في هذه الجزيرة يدعى مطار سيمور إلى جزيرة سانتا كروز في الجنوب وبالعكس. توفر هذه القناة أيضا مرسى للسفن السياحية الصغيرة ونقطة تفريغ لسفن الشحن التي تحمل البضائع من البر الرئيسي للاكوادور إلى جزيرة سانتا كروز. ويتم نقل هذه البضائع بالشاحنات برا إلى مدينة بويرتو أيورا. يبلغ عرض هذه القناة حوالي 350 متر في أضيق نقطة لها.