أقيمت قرعة الشان في 18 نوفمبر 2017 حيث ستقسم المنتخبات المتأهلة إلى 4 مجموعات من 4 منتخبات.
سيتم تقسيم المنتخبات على 4 وعائات حسب تصنيف الكاف لشهر نوفمبر 2017، الوعاء الأول سيحمل تلقائيا المنتخب المضيف (أول المجموعة أ تلقائيا) فيما تتوزع المنتخبات الثلاثة الأخرى على رؤوس باقي المجموعات، مع اتباع نفس الطريقة مع الوعاء 2، 3 و4.
أسفرت قرعة كأس أمم إفريقيا للمحليين (شان 2018)، عن مجموعات متوازنة، حيث تضم المجموعة الأولى، التي ستقام مبارياتها في ملعب محمد الخامس بالدار البيضاء، منتخبات المغرب وموريتانيا والسودان وغينيا؛ وتضم المجموعة الثانية، التي ستقام مبارياتها في ملعب مراكش، منتخبات كوت ديفوار وناميبيا وأوغندا وزامبيا؛ وتضم المجموعة الثالثة، التي يحتضن مبارياتها ملعب طنجة منتخبات ليبيا وغينيا الاستوائية ورواندا ونيجيريا؛ فيما تتواجه في المجموعة الرابعة والأخيرة، التي يحتضن مبارياتها ملعب أدرار بأغادير، منتخبات أنغولا وبوركينا فاسو والكونغو والكاميرون.
وتقرر أن يحتضن ملعب محمد الخامس بالدار البيضاء مباراتي افتتاح واختتام البطولة، التي تنظم خلال الفترة ما بين 13 يناير و4 فبراير المقبل.