القواعد النيتروجينية هي مركبات عضوية ترجع خواصها القاعدية لزوج الإلكترونات الوحيد في ذرة النيتروجين. ومن القواعد النيتروجينية التقليدية الأمونيا (NH3), ثلاثي ايثيل أمين، بيريدين؛ ومنها أيضا ما يدخل في تركيب الدنا والرنا: أدينين، جوانين، ثايمين، سايتوسين، ويوراسيل.
الوظيفة الحيوية للقواعد النيتروجينية هي ربط الأحماض النووية مع بعضها البعض. توجد في القاعدة النيتروجينية ذرة نيتروجين لها خواص قاعدية . وتنتسب الخواص القاعدية للقاعدة النيتروجينية إلى أيون زوجي للكترونات في ذرة النيتروجين.
تعتبر القواعد النيتروجينية مشتقات من جزيئات أكبر منها: بيريميدين وبورين.
البيريميدينات والبورينات ليست قطبية بسبب كونها مثلثة الشكل ومسطحة . وهي تشبه بيريدين، وهي لذلك قواعد ضعيفة.