قاعدة برنيس العسكرية هي قاعدة عسكرية مصرية تقع في منطقة برنيس جنوب محافظة البحر الأحمر بالقرب من الحدود المصرية السودانية على الساحل الغربي للبحر الأحمر. تُعد من أكبر القواعد العسكرية في منطقة البحر الأحمر، وتضم قاعدة بحرية وأخرى جوية إضافة إلى منشآت لوجستية وعسكرية متكاملة.
تتمثل المهمة الرئيسية للقاعدة في حماية وتأمين السواحل المصرية الجنوبية، وتأمين خطوط الملاحة في البحر الأحمر، ودعم القدرات العملياتية للقوات المسلحة المصرية في الاتجاه الإستراتيجي الجنوبي.