نائب رئيس جمهورية إندونيسيا (الإندونيسية: Wakil Presiden Republik Indonesia) هو ثاني أعلى منصب في السلطة التنفيذية للحكومة الإندونيسية بعد الرئيس، ويحتل المرتبة الأولى في ترتيب خلافة الرئاسة. منذ عام 2004، يُنتخب الرئيس ونائبه مباشرةً لولاية مدتها خمس سنوات كمرشحين منفردين.
أُنشئ منصب نائب الرئيس خلال صياغة دستور عام 1945 من قِبل لجنة التحقيق للعمل التحضيري من أجل الاستقلال (BPUPK)، وهي هيئة بحثية أُنشئت لإعداد استقلال إندونيسيا. في 18 أغسطس 1945، اختارت اللجنة التحضيرية لاستقلال إندونيسيا (PPKI)، التي شُكّلت في 7 أغسطس لتحل محل لجنة التحقيق في الأعمال التحضيرية للاستقلال، سوكارنو ليكون أول رئيس للبلاد ومحمد حاتا نائبًا له.