كنيسة القبطية الأرثوذكسية في الإسكندرية هي الاسم الرسمي لأكبر كنيسة مسيحية في مصر. تنتمي كنيسة إلى عائلة الكنائس الأرثوذكسية الشرقية منذ مجمع خلقيدونية عام 451م. أسس هذه كنيسة الرسول والإنجيلي القديس مرقس في القرن الأول. رئيس كنيسة هو بابا كنيسة القبطية الأرثوذكسية.
فيما يلي قائمة جزئية للكنائس القبطية الأرثوذكسية في مصر. ويبلغ عددها 2000 كنيسة.
ملحوظة: يوجد في هذة القائمة 372 كنيسة وكاتدرائية فقط.