تُعد الأقاليم (بالإندونيسية: kabupaten) والمدن (بالإندونيسية: kota) هي المستوى الثاني من التقسيمات الإدارية في إندونيسيا، وتقع مباشرة تحت مستوى المقاطعات، وفوق مستوى المديريات (الضواحي). تعادل الأقاليم الإندونيسية تقريباً نظام "المقاطعات" (counties) في دول أخرى، بينما تمتاز المدن بنشاط اقتصاد غير زراعي. ومنذ بدء تطبيق نظام اللامركزية في 1 يناير 2001، أصبحت الأقاليم والبلديات هي الوحدات الإدارية الرئيسية المسؤولة عن تقديم معظم الخدمات الحكومية. وتمتلك كل مدينة أو إقليم حكومة محلية وهيئة تشريعية خاصة بها.
يكمن الفرق بين "الإقليم" (kabupaten) و"المدينة" (kota) في الخصائص الديموغرافية والمساحة والاقتصاد. بشكل عام، يغطي الإقليم مساحة ريفية أكبر من المدينة، ويضم عدة بلدات، بينما تتركز المدينة في المناطق الحضرية. يرأس الإقليم "وصي" أو حكام (bupati)، بينما يرأس المدينة "عمدة" (wali kota). ويتم انتخاب الحكام والعمد وأعضاء المجالس التشريعية مباشرة لمدة خمس سنوات قابلة للتجديد مرة واحدة.
يوجد أيضاً ما يسمى بـ المدن الإدارية (kota administrasi) أو الأقاليم الإدارية (kabupaten administrasi)، وهي تقسيمات تابعة للمقاطعة دون وجود مجالس تشريعية محلية خاصة بها، ويتم تعيين رؤسائها مباشرة من قبل الحاكم. هذا النوع من التقسيم لا يوجد إلا في العاصمة جاكرتا، التي تتكون من خمس مدن إدارية وإقليم إداري واحد.
اعتباراً من يناير 2023، كان هناك 514 قسماً إدارياً من المستوى الثاني (416 إقليماً و98 مدينة) في إندونيسيا. تدرج القائمة أدناه الأقاليم والمدن حسب المقاطعات، مع تحديد المركز الإداري لكل منها.