قائد القوات المسلحة الوطنية الإندونيسية هو أعلى منصب في القوات المسلحة الوطنية الإندونيسية. يشغل هذا المنصب الجنرال الأميرال: إير مارشال، المعين من قبل رئيس إندونيسيا ويقدم تقاريره مباشرة إليه.
أول قائد رسمي للقوات المسلحة الوطنية الإندونيسية هو الجنرال سوديرمان، في ذلك الوقت يُعرف هذا المنصب باسم القائد العام لقوات الأمن الشعبية، والذي سيُطلق عليه فيما بعد قائد جيش جمهورية إندونيسيا، وقائد القوات العسكرية لجمهورية إندونيسيا. كقائد أول، لم يتم تعيين الجنرال سوديرمان من قبل رئيس إندونيسيا، بدلاً من ذلك ينتخب من قبل أفراد القوات المسلحة لأمن الشعب خلال اجتماع يُعرف باسم مؤتمر القوات المسلحة لأمن الشعب في 12 نوفمبر 1945. قبل تعيين الجنرال سوديرمان كان يتم شغل المنصب بقلم اللفتنانت جنرال أوريب على أساس مؤقت.
يشغل هذا المنصب حاليًا الجنرال أنديكا بيركاسا، وهو ضابط بالقوات البرية الإندونيسية، عينه الرئيس جوكو ويدودو في 17 نوفمبر 2021.