فرط النمو البكتيري في الأمعاء الدقيقة هو اضطراب معوي يؤدي إلى تواجد أنواع من البكتيريا في الأمعاء الرفيعة لا تتواجد عادة هناك في الأصحاء أو تواجد الأنواع المعتادة لكن بأعداد كبيرة نسبيًا. تسبب هذه الحالة جملة من الأعراض تختلف بين الاشخاص لكن يغلب ما يلي: الإسهال أو الإمساك، أوجاع، لعيان، مغص معوي، تشوش ذهني أو ضبابية المخ، سوء امتصاص وسوء تغذية. هناك عدة مسببات أبرزها: كسل صغرمعوي، استئصالات معوية، انخفاض الأحماض المِعَدية، الاستخدام المفرط للمضادات الحيوية.
تشخص الحالة ب الاختبار الهيدروجيني للنفس أو بخزعة من الصائم. وتعالج بمزيج من المضادات الحيوية الخاصة ونظام غذائي صارم.