شاركت غينيا الاستوائية لأول مرة في الألعاب الأولمبية في عام 1984، وأرسلت رياضيين للمنافسة في كل دورات الألعاب الأولمبية الصيفية منذ ذلك الحين. لم تشارك حتى الأن بأي من دورات الألعاب الأولمبية الشتوية.
حتى عام 2020، لم يفز أي رياضي من غينيا الاستوائية بميدالية أولمبية. أشهر رياضي أولمبي في البلاد هو إريك موسامباني، الذي حقق بعض الشهرة الدولية لأدائه البطيء بشكل استثنائي في السباحة في دورة الألعاب الأولمبية الصيفية لعام 2000.
انشأت اللجنة الأولمبية الوطنية لغينيا الاستوائية في عام 1980 واعترفت بها اللجنة الأولمبية الدولية في عام 1984.