علم الوراثة وعلم الأركيولوجيا الجينية في جنوب آسيا هو دراسة علم الوراثة وعلم الأركيولوجيا الجينية للمجموعات العرقية في جنوب آسيا. ويهدف إلى الكشف عن التاريخ الجيني لهذه المجموعات. يجعل الموقع الجغرافي لشبه القارة الهندية تنوعها البيولوجي مهمًا لدراسة الانتشار المبكر للبشر المعاصرين تشريحيًا عبر آسيا.
استنادًا إلى اختلافات الحمض النووي للميتوكوندريا (دنا متقدرة)، أظهرت الوحدة الجينية عبر مجموعات سكانية فرعية مختلفة في جنوب آسيا أن معظم عقد الأسلاف لشجرة النشوء والتطور لجميع أنواع mtDNA نشأت في شبه القارة الهندية. لقد تنوعت استنتاجات الدراسات المستندة إلى تباين كروموسوم Y وتباين الحمض النووي الجسدي.
يمكن وصف التركيب الجيني لجنوب آسيا المعاصرين بأنه مزيج من أصول غرب أوراسيا مع أصول شرق أوراسية متباينة. يتضمن الأخير في المقام الأول مكونًا أصليًا مقترحًا من جنوب آسيا (تسمى سلالة جنوب الهند القديمة، باختصار AASI) يرتبط ارتباطًا وثيقًا بالشعوب الأندامانية، وكذلك بشرق آسيا والسكان الأصليين الأستراليين، كما يتضمن أيضًا مكونات إضافية متغيرة إقليميًا من جنوب وجنوب شرق آسيا.
السلالة المقترحة من نوع أسلاف الهنود الجنوبيين القدماء هي الأقرب إلى الجزء غير الأوراسي الغربي، المسمى S-component، المستخرج من عينات جنوب آسيا، وخاصة تلك من قبيلة إيرولا، وتوجد بشكل عام في جميع المجموعات العرقية في جنوب آسيا بدرجات متفاوتة. يشكل أصل غرب أوراسيا، على وجه التحديد المكون المرتبط بإيران القديمة، المصدر الرئيسي للتركيب الجيني لجنوب آسيا، ومع درجات متفاوتة من أصل أسلاف الهنود الجنوبيين القدماء، شكلت سلالة السند المحيطية حوالي 5400-3700 قبل الميلاد، والتي تشكل السلف الرئيسي لتراث معظم مجموعات جنوب آسيا الحديثة. اختلطت أسلاف منطقة السند، حوالي الألفية الثانية قبل الميلاد، مع موجة غرب أوراسية أخرى، وهي مكون يامنايا-السهوب الوافد الذي يتوسطه الذكور في الغالب لتشكيل أسلاف هنود الشمال (ANI)، بينما ساهمت في نفس الوقت في تكوين أسلافهم. الهنود الجنوبيون (ASI) عن طريق الاختلاط مع الصيادين وجامعي الثمار الذين لديهم نسب أعلى من السلالة المرتبطة بسلالة جنوب الهند القديمة. يطلق على تدرج ANI-ASI، كما يتضح من النسبة الأعلى من ANI في الطبقة العليا تقليديًا والمتحدثين الهندو-أوروبيين، والذي نتج بسبب الاختلاط بين ANI وASI بعد عام 2000 قبل الميلاد بنسب مختلفة، اسم الخط الهندي. يشكل عنصر الأصل الشرقي آسيوي الأصل الرئيسي بين المتحدثين التبتيين البورميين والخاسيين، ويقتصر بشكل عام على سفوح جبال الهيمالايا وشمال شرق الهند، مع وجود كبير أيضًا في المجموعات الناطقة بلغة موندا، وكذلك في بعض السكان في شمال ووسط ووسط الهند. شرق جنوب آسيا.