العلاج بالرنين المغناطيسي (بالإنجليزية: Magnetic Resonance Therapy) هي طريقة تُختبر حاليا للعلاج تعتمد على الخاصية الفيزيائية :الرنين النووي المغناطيسي . والغرض منها تحفيز وظائف في بعض الخلايا في الأحياء وفي الأنسجة الحية. ولا توجد حتى الآن اختبارات على نطاق واسع لتلك الطريقة في المستشفيات .
يستخدم العلاج في الغالب كتكملة للعلاج حالات تخاذل النظام العضلي العظمي musculoskeletal system المصحوب بآلام شديدة. وتستخدم طريقة الرنين المغناطيسي في مستشفيات كثيرة حول العالم وفي مصحات النقاهة . وتدعمها مراكز علمية مثل «معهد لودفيج بولتزمان» في سالفيلدن بالنمسا. ويعتبر العلاج كعلاج استبدالي طبي حيث لم يعترف به بعد كأحد العلاجات الطبية المعترف بها . أي أن نتائج تلك الطريقة العلاجية لا زالت تحت الاختبار .