الطحالب الزرقاء (الاسم العلمي: Glaucophyta) (glaucocystids) هي شعبة عليا من النباتات.
وهي مجموعة صغيرة من طحالب المياه العذبة المجهرية. وهي تشكل مع الطحالب الحمراء والطحالب الخضراء بالإضافة إلى النباتات البرية ما يُعرف باسم الصانعات العتيقة. ومع ذلك، فإن العلاقات بين الطحالب الحمراء والطحالب الخضراء والطحالب الزرقاء غير واضحة المعالم، في جزء كبير منها نظرًا لقلة الدراسات التي تتناول الطحالب الزرقاء.
وتعد الطحالب الزرقاء محط اهتمام علماء الأحياء الذين يدرسون تطوير البلاستيدات الخضراء لأن بعض الدراسات تشير إلى أنها قد تكون مشابهة لنوع الطحالب الأصلية التي أدت إلى وجود النباتات الخضراء والطحالب الحمراء.