ضريح الأغا خان هو ضريح آغا خان الثالث (السلطان محمد شاه)، المتوفى سنة 1957، ويقع على ضفاف النيل في مدينة أسوان المصرية. حيث مثلت مصر سابقاً مركز قوة الفاطميين، وهم سلالة شيعية إسماعيلية. وهو حالياً أيضاً مثوى آغا خان الرابع.
بدأ بناء الضريح في 1956 وانتهى في 1960. أمرت زوجة آغا خان الثالث، بيغوم أم حبيبة آغا خان، ببناء الضريح، الذي كان يستقبل السياح في البداية؛ إلا أنه أُغلق أمام العامة في 1997.
توضع وردة حمراء على قبر آغا خان الثالث كل يوم - وهي عادة بدأتها بيغوم أم حبيبة آغا خان.