إندونيسيا الشرقية أو شرق إندونيسيا هي إحدى المنطقتين الجغرافيتين الرئيسيتين في إندونيسيا، والمنطقة الأخرى هي إندونيسيا الغربية. تتألف من أربع وحدات جغرافية: جزر سوندا الصغرى، وسولاويزي، وجزر مالوكو، وبابوا. يُعتبر توقيت وسط إندونيسيا وتوقيت شرق إندونيسيا التوقيت الوطني المعتمد لشرق إندونيسيا، ويقعان ضمن النطاق الزمني UTC+8 وUTC+9 على التوالي.
تحد إندونيسيا الشرقية من الشمال جنوب الفلبين وبالاو، ومن الشرق بابوا غينيا الجديدة، ومن الجنوب شمال أستراليا.