سيستين بروتياز المعروف أيضا باسم ثيول البروتياز (بالإنجليزية: Cysteine protease) وهي الأنزيمات التي تحلل البروتينات. تتشارك هذه الانزيمات في آلية تحفيزية شائعة تشتمل على ثيول السيستين المحب للنواة ثنائي أو ثلاثي التحفيز.
وتكون عادة انزيمات السيستين في الفواكه بما في ذلك البابايا والأناناس والتين والجريفروت. نسبة البروتياز تميل إلى أن تكون أعلى عندما تكون الفاكهة غير ناضجة. في الواقع من المعروف أن عشرات من اللاتكس من عائلات نباتية مختلفة تحتوي على انزيمات السيستين. وتستخدم أيضا كمكون في مغرضات اللحوم.