السيانوتوكسين هي سموم تنتجها البكتيريا الزرقاء (المعروفة أيضًا باسم الطحالب الزرقاء الخضراء). توجد البكتيريا الزرقاء الخضراء في كل مكان تقريبًا، ولكن بشكل خاص في البحيرات والمحيطات حيث تتكاثر بشكل كبير لتشكل تجمعات تحت ظروف تركيز الفوسفور العالي. يمكن للبكتيريا الزرقاء المزهرة أن تنتج السيانوتوكسين بتركيزات تجعلها قادرة على تسميم وحتى قتل الحيوانات والبشر. يمكن أن تتراكم السيانوتوكسين أيضًا في حيوانات أخرى مثل الأسماك والمحار، وتسبب التسمم مثل تسمم المحار.
بعض أقوى السموم الطبيعية المعروفة هي السيانوتوكسين. وهي تشمل سموم عصبية قوية، وسموم كبدية، وسموم خلوية، وسموم داخلية. يشير مصطلح "السيانو" في مصطلح البكتيريا الزرقاء إلى لونها، وليس إلى علاقتها بالسيانيد، على الرغم من أن البكتيريا الزرقاء يمكن أن تستقلب سيانيد الهيدروجين أثناء تثبيت النيتروجين.
يمكن أن يؤدي التعرض للبكتيريا الزرقاء إلى أعراض الجهاز الهضمي وحمى القش أو الطفح الجلدي الحاك. قد يكون التعرض لسموم الأعصاب في البكتيريا الزرقاء، سببًا بيئيًا للأمراض العصبية التنكسية مثل التصلب الجانبي الضموري (ALS) ومرض باركنسون ومرض الزهايمر. هناك أيضًا اهتمام بالقدرة العسكرية للسموم العصبية البيولوجية مثل السيانوتوكسين، والتي "اكتسبت أهمية متزايدة كمهددات محتملة للأسلحة".
ظهر أول تقرير منشور يفيد بأن الطحالب الزرقاء الخضراء أو البكتيريا الزرقاء يمكن أن يكون لها آثار قاتلة في مجلة نيتشر عام 1878. وصف جورج فرانس ازدهار الطحالب الذي لاحظه في مصب نهر موراي في أستراليا بأنه "رغوة سميكة تشبه دهان الزيت الأخضر، بسمك بوصتين إلى ست بوصات". ماتت الحياة البرية التي شربت الماء بسرعة وبشكل مروع. وقعت معظم الحوادث المبلغ عنها للتسمم بالسموم الدقيقة في البيئات المائية العذبة، وأصبحت أكثر شيوعًا وانتشارًا. على سبيل المثال، مات الآلاف من البط والإوز بشرب مياه ملوثة في الولايات المتحدة الوسطى الغربية. في عام 2010، لأول مرة، اُبلغ عن موت الثدييات البحرية بسبب ابتلاع السيانوتوكسين.