سموم بكتيرية (الإنجليزية: Bacterial toxin) هو سموم ينتجه البكتيريا
.قد تكون هذه السموم البكتيرية مرضية مثل التي تسببها البكتيريا العنقودية الذهبية
يمكن تصنيفها إلى نوعين:
سموم خارجي تفرزه البكتيريا
سموم داخلي وهو جزء من البكتيريا نفسها، ويكون عادة جزء من الغشاء الخارجي الجرثومي.
تستخدم بعض أنواع السموم البكتيرية في علاج الأورام.