سلفات الكوندرويتين (بالإنجليزية: Chondroitin sulfate) هو ملح سلفات لغليكوز أمينوغليكان يتكون من سلسلة من سكريات هي ن-أسيتيل غالاكتوزامين وحمض ايديورونيك. توجد سلفات الكوندرويتين عادة مرتبطة ببروتينات على شكل بروتيوغليكان.
تتكون سلسلة الكوندرويتين من أكثر من 100 وحدة سكر، يمكن لكل واحدة من هذه الوحدات أن ترتبط بالسلفات بكميات ومواقع مختلفة.
سلفات الكوندرويتين مادة مهمة في تكوين الغضاريف، ويمنحها مقاومة للإنضغاط.