سفارة سلطنة عُمان في طوكيو هي البعثة الدبلوماسية لسلطنة عُمان لدى اليابان منذ عام 1979.
ويشغل منصب السفير سعادة الدكتور محمد سعيد البوسعيدي، الذي يتولى أيضاً مهام سفير عُمان غير المقيم لدى أستراليا ونيوزيلندا.
ويقع مقر السفارة في العنوان التالي: 4-2-17 هيرو، شيبويا-كو، طوكيو 150-0012، اليابان.
صُمم مبنى السفارة الحالي وشُيّد بواسطة شركة ياسوي للهندسة المعمارية. اكتمل بناء المبنى عام 2009، وهو مبنى من الحجر الأبيض مكون من سبعة طوابق، ويتوسطه شعار ذهبي يصور خنجر عُمان التقليدي فوق سيفين متقاطعين فوق المدخل.
تستخدم سلطنة عُمان ودول خليجية أخرى السفارة لعقد اجتماعات ثنائية ومتعددة الأطراف، وفعاليات تهدف إلى الترويج للعالم العربي في اليابان، وتعزيز العلاقات التجارية بين البلدين.