وفقًا للقسم الرابع من الجزء الرئيسي الأول من دستور ولاية بافاريا الحرة فإن رئيس وزراء بافاريا هو رئيس حكومة ولاية بافاريا.
ماركوس زودر من حزب الاتحاد الاجتماعي المسيحي (CSU) هو رئيس وزراء ولاية بافاريا الحرة منذ 16 آذار 2018. شغل المنصب خلفاً لهورست سيهوفر (CSU)، الذي انتقل إلى حكومة ميركل الرابعة كوزير للداخلية والبناء والشؤون الداخلية.