رئيس جمهورية مرتفعات قرة باغ هو أعلى منصب سياسي في جمهورية مرتفعات قرة باغ بعد إعلان استقلال البلاد سنة 1991.
أول رئيس تم انتخابه في 24 ديسمبر 1994، والاسم الرئيسي لهذا المنصب تم إقراره في دستور جمهورية مرتفعات قرة باغ و هو: رئيس جمهورية مرتفعات قرة باغ. الرئيس هو أيضا القائد الأعلى للقوات المسلحة للجمهورية.
وافقت آرتساخ على حل نفسها بحلول 1 يناير 2024 بعد الهجوم الأذربيجاني في 19 سبتمبر 2023، ولكن بدلا من حلها أسسوا حكومة في المنفى في يريفان، أرمينيا. لكن عارض رئيس وزراء أرمينيا، نيكول باشينيان، بشدة وجود حكومة المنفى في أرمينيا.