بدأت فترة ولاية جونسون بصفته الرئيس رقم 36 للولايات المتحدة الأمريكية في 22 نوفمبر من عام 1963، في أعقاب اغتيال الرئيس كينيدي وانتهت في 20 يناير عام 1969. وعند توليه الرئاسة كان جونسون قد شغل منصب نائب الرئيس لمدة 1063 يومًا. كممثل عن الحزب الديمقراطي من تكساس، ترشح وفاز بفترة ولاية كاملة مدتها أربع سنوات في انتخابات عام 1964، بعد فوزه بأغلبية ساحقة على الخصم الجمهوري عضو مجلس شيوخ أريزونا باري غولدووتر. لم يترشح جونسون لولاية ثانية كاملة في الانتخابات الرئاسية لعام 1968. وخلفه في منصب الرئاسة الجمهوري ريتشارد نيكسون. شكلت رئاسته ذروة الليبرالية الحديثة في الولايات المتحدة الأمريكية.
وسع جونسون تطبيق الصفقة الجديدة من خلال برنامج المجتمع العظيم الذي كان عبارة عن سلسلة من البرامج التشريعية المحلية لمساعدة الفقراء والمسحوقين. بعد توليه المنصب، حصل جونسون على إقرار بتخفيض ضريبي كبير، قانون الهواء النظيف، وقانون الحقوق المدنية لعام 1964. بعد انتخابات عام 1964، أقر جونسون إصلاحات أكثر شمولًا. أقامت تعديلات الضمان الاجتماعي لعام 1965 برنامجين للرعاية الصحية تديرهما الحكومة، ميديكير وميديكيد. يمنع قانون حق التصويت لعام 1965 التمييز العنصري في الاقتراع، وقد منح إقراره حق التصويت للملايين من الأمريكيين الجنوبيين من أصل أفريقي. وأعلن جونسون تشريع «الحرب على الفقر» وأسس برامج عديدة كانت تهدف إلى مساعدة المفقرين. وقد أشرف أيضًا على زيادات كبيرة في التمويل الفيدرالي للتعليم ونهاية فترة قوانين الهجرة المقيدة.
في الشؤون الخارجية هيمنت الحرب الباردة وحرب فيتنام على السياسة الخارجية لرئاسة جونسون. واتبع سياسات توفيقية مع الاتحاد السوفييتي، الأمر الذي مهد الطريق لانفراج دولي في السبعينيات من القرن العشرين. ومع ذلك فقد أبدى جونسون التزامًا بسياسة الاحتواء، وزاد من الوجود الأمريكي في فيتنام بهدف إيقاف المد الشيوعي في جنوبي شرق آسيا خلال الحرب الباردة. وازداد عدد العسكريين الأمريكيين في فيتنام بصورة كبيرة، فقد ارتفع عددهم من 16 ألف جندي في عام 1963 إلى ما يزيد عن 500 ألف في عام 1968. حفز الغضب المتزايد من الحرب حركة ضخمة تعارض تدخل الولايات المتحدة في حرب فيتنام ارتكزت بشكل خاص على الجامعات في الولايات المتحدة وخارجها. واجه جونسون المزيد من المشكلات مع اندلاع أعمال شغب في الصيف في معظم المدن الكبرى بعد عام 1965. وفي حين أنه بدأ رئاسته بقبول واسع الانتشار، انخفض التأييد الشعبي لجونسون مع استمرار الحرب وتزايد الاضطرابات المحلية في كافة أنحاء البلاد. وفي الوقت نفسه، تفكك تحالف الصفقة الجديدة الذي كان قد وحد الحزب الديمقراطي، وتلاشى تأييد جونسون بتفكك ذلك التحالف.
على الرغم من أهليته لولاية أخرى، أعلن جونسون في شهر مارس من عام 1968 أنه لا يسعى إلى الترشح مجددًا. وفاز خلفه المفضل، نائب الرئيس هوبرت هومفري، بالترشح عن الحزب الديمقراطي إلا أنه هُزم من قبل ريتشارد نيكسون في الانتخابات العامة. وبالرغم من مغادرته للبيت الأبيض بنسب دعم متدنية، تميل استطلاعات الرأي التي أجراها المؤرخون وعالمو السياسة إلى تصنيف جونسون كرئيس فوق المتوسط. غيرت برامجه المحلية الولايات المتحدة ودور الحكومة الفيدرالية، وما تزال العديد من برامجه سارية حتى اليوم. ما يزال تعامل جونسون مع حرب فيتنام غير محبب على وجه العموم، إلا أن مبادراته في مجال الحقوق المدنية تحظى بثناء عالمي تقريبًا لدورها في إزالة الحواجز في وجه المساواة العرقية.
كان رامسي كلارك آخر عضو من إدارة جونسون ما يزال على قيد الحياة، وقد توفي في 9 أبريل 2021.