بدأت ولاية رودريغو دوتيرتي الممتدة ست سنوات بوصفه الرئيس السادس عشر للفلبين ظهر يوم 30 يونيو 2016، خلفًا لبنيغنو آكينو. وكان أول رئيس ينحدر من مينداناو، وأول رئيس عمل في الفروع الثلاثة للحكومة، كما كان الأكبر سنًا بين من انتُخبوا للمنصب. وعملًا بما ينص عليه الدستور، انتهت ولايته بعد ست سنوات في 30 يونيو 2022، وخلفه بونغ بونغ ماركوس.
فاز دوتيرتي في الانتخابات في ظل تصاعد الإحباط الشعبي من نظام الحكم الذي أعقب ثورة إدسا، والذي عُدّ منحازًا إلى النخب على حساب عموم الفلبينيين. واستهل ولايته بإطلاق حملة صارمة على المخدرات غير المشروعة وعلى الفساد, ما أدى إلى تراجع انتشار المخدرات، لكنه أسفر أيضًا عن مقتل 6,600 شخص. وخلال هذه الحملة، انسحبت الفلبين من المحكمة الجنائية الدولية (ICC) بعدما شرعت المحكمة في فحص أولي بشأن مزاعم جرائم ضد الإنسانية ارتُكبت أثناء الحملة. وفي 11 مارس 2025، أُلقي القبض على دوتيرتي من قِبل الشرطة الوطنية الفلبينية ومنظمة الشرطة الجنائية الدولية عقب صدور مذكرة توقيف من المحكمة الجنائية الدولية تتعلق بالجرائم المزعومة خلال رئاسته، على أن تُؤكَّد التهم في 23 سبتمبر 2025.
عزّز دوتيرتي الإنفاق على البنية التحتية وأطلق برنامج «Build! Build! Build!» الطموح. كما بادر إلى إصلاحات اقتصادية ليبرالية، شملت إصلاح النظام الضريبي. وأرسى كذلك حرية تداول المعلومات ضمن السلطة التنفيذية للحد من الفساد والبيروقراطية. وإلى جانب ذلك، أقرّ الري المجاني لصغار المزارعين، وحرّر واردات الأرز عبر قانون تعرفة الأرز.
نفّذ دوتيرتي حملة لمكافحة الإرهاب ووقّع قانون مكافحة الإرهاب المثير للجدل. كما أعلن الأحكام العرفية في مينداناو خلال أزمة مراوي، ومدّدها لعامين، لتكون أطول فترة أحكام عرفية في الفلبين منذ فرديناند ماركوس وحكمه الذي دام 14 عاماً. وسعى إلى إجراء محادثات سلام مع الحزب الشيوعي الفليبيني (CPP)، لكنه ألغى تلك المحادثات في فبراير 2017 بعد هجمات شنتها «الجيش الشعبي الجديد» (NPA) على القوات الحكومية، وأعلن الحزب وجناحه المسلح منظمتين إرهابيتين. وأنشأ فرق عمل لإنهاء الصراع الشيوعي المسلح على المستوى المحلي وإعادة دمج المتمردين السابقين، كما سنّ قانونًا يقضي بإنشاء إقليم بانغسامورو ذاتي الحكم ومنح العفو للمتمردين السابقين.
أقرّ دوتيرتي التعليم الجامعي المجاني في الجامعات والكليات الحكومية، ورسّخ نظام التعليم البديل. ووقّع كذلك قرار التسجيل التلقائي لجميع الفلبينيين في برنامج التأمين الصحي الحكومي، وأمر بالتنفيذ الكامل لقانون الصحة الإنجابية. وفي مواجهة جائحة كوفيد-19، طبّق في البداية إجراءات إغلاق صارمة، ما أدى إلى انكماش الناتج المحلي الإجمالي بنسبة 9.5% عام 2020. غير أنه مع إعادة فتح الاقتصاد تدريجياً، ارتفع الناتج المحلي الإجمالي بنسبة 5.6% في عام 2021.
سعى دوتيرتي إلى تحسين العلاقات مع الصين وروسيا وتقليص الاعتماد على الولايات المتحدة. واتخذ موقفًا تصالحيًا تجاه الصين، متجاوزًا الحكم المثير للجدل في قضية "الفلبين ضد الصين" بشأن مطالبات بحر الصين الجنوبي.
يُعد دوتيرتي شخصية مثيرة للانقسام، إذ واجه انتقادات ومعارضة دولية بسبب جهوده في مكافحة المخدرات. ومع ذلك، ترى مؤسسات استطلاع رأي عدة، مثل بابليكوس آسيا ونبض آسيا، أن معدلات تأييده ظلت مرتفعة خلال رئاسته وبعدها، وفقًا لاستطلاعاتها الخاصة، ما جعله الرئيس الأكثر شعبية في مرحلة ما بعد ثورة «قوة الشعب».
فاز دوتيرتي في الانتخابات الرئاسية لعام 2016 بعد أن خاض حملته على برنامج يقوم على مكافحة الجريمة، والفساد، والمخدرات غير المشروعة، جامعًا 16٬601٬997 (39٫02%) صوتاً، ومتغلبًا على زعيم الحزب الليبرالي مارس روكساس بفارق تجاوز 6.6 ملايين صوت.
في 9 مايو 2016، أعلن كونغرس الفلبين دوتيرتي فائزًا بالانتخابات الرئاسية. وشُكِّل فريق الانتقال الخاص به بعدما تصدّر بفارق كبير في الفرز غير الرسمي الذي أجرته لجنة الانتخابات (COMELEC) ومجلس الرعايا الرعوي للتصويت المسؤول. وتولى فريق الانتقال الإعداد لمقر الإقامة الرئاسي الجديد والتعيينات الوزارية، كما عقد اجتماعات مع الإدارة المنتهية ولايتها.
في 30 يونيو 2016، قام بينفينيدو ل. رييس، القاضي المساعد في المحكمة العليا للفلبين وعضو منظمة أخوية ينتمي إليها دوتيرتي، بتنصيب دوتيرتي رئيسًا سادس عشر للفلبين، وذلك في مراسم بسيطة أُقيمت في أكبر قاعات قصر مالاكانانغ في مانيلا. وكانت هذه رابع مراسم تنصيب تُعقد في مالاكانانغ، والأولى منذ إرساء حقبة تاريخ الفلبين (1986-الحاضر).