الالتهاب الرئوي بالمتكيسة الجؤجؤية أو ذات الرئة بالمتكيسة الجؤجؤية (بالإنجليزية: Pneumocystis jirovecii pneumonia) هو أحد أنواع ذات الرئة سببه خميرة شبيهة بالفطر اسمها المتكيسة الرئوية الجؤجؤية.
الالتهاب الرئوي بالمتكيسة الجؤجؤية غير شائع عند الأصحاء، لكنه يحدث عن طريق عدوى انتهازية، فتسبب عدوى الرئة عند المرضى الذين يشكون من نقص المناعة. يظهر الالتهاب الرئوي بالمتكيسة الجؤجؤية عند مرضى السرطان الذين يتلقون علاجا كيميائيا والمصابين بمتلازمة العوز المناعي المكتسب والذين يستخدمون أدوية تثبط المناعة.