خوان فلوريس (الإسبانية: Juan Flores Madariaga) هو لاعب كرة قدم هندوراسي في مركز الهجوم، ولد في 8 مارس 1964 في El Porvenir, Atlántida ‏ في هندوراس. لعب مع سانتوس لاغونا.