خواجة يحيى (توفي حوالي 1694 م)، والمعروف عمومًا باسم يايا خوجة (بالفارسية: خواجہ یحیی) ، هو ابن آفاق الحواجة، كان من طائفة طريقة الجبل الأبيض الخواجة من خانية يرقند في منطقة كاشغر في نهاية القرن السابع عشر. كان جده أحمد الكاساني رجل من منطقة فرغانة في آسيا الوسطى.
في عام 1680، وبمساندة قبيلة جونغار المغولية، أصبح إدريس ياتولّلا (伊達雅圖勒拉)، والد يَيا خوجة (雅雅和卓)، الزعيمَ الديني الإسلامي للمناطق الممتدة في كاشغر ويرقَنْد (وهما اليوم ضمن إقليم كاشغر في شينجيانغ الصينية). أما يَيا خوجة، فقد تمركز في كاشغر، التي كانت آنذاك المقرّ الرئيس للطريقة الصوفية البيضاء الجبلية (白山派) في بلاد التركستان الغربية. وبعد عام 1682، تفاقم الصراع بين أتباع الطريقة البيضاء الجبلية والسلطة الزمنية في يرقَنْد. عندئذٍ شارك يَيا خوجة بنشاط في النزاع السياسي الدائر بين والده إدريس ياتولّلا والخان محمد أمين (馬哈麻特額敏)، حاكم يرقَنْد، وتمكّن – بتوجيه من والده – من قمع تمردٍ كبير. وفي عام 1692، خطط الخان أمين للقضاء على الطريقة البيضاء الجبلية، فقاد يَيا خوجة جيشه من كاشغر إلى يرقَنْد (في منطقة شاچوَر الحالية) لمساندة والده. انتهت المعركة بهزيمة أمين خان ومقتله، فأصبح إدريس ياتولّلا الحاكم الفعلي لمناطق كاشغر ويرقَنْد. في ذلك الوقت أعلن يَيا خوجة نفسه خانا على كاشغر.
وفي مطلع عام 1694، توفي إدريس ياتولّلا في يرقَنْد. وبعد وفاته، سعت زوجته الأخيرة خانيم بادشاه (哈尼木·帕的沙) — وهي أخت أمين خان المتوفى وتنتمي إلى السلالة الحاكمة — إلى تنصيب ابنها محمد خوجة (瑪哈氐和卓) خانا على يرقَنْد. لكن يَيا خوجة، بصفته الابن الأكبر ووريث حكم كاشغر، رفض ذلك، ونشبت بينه وبين خانيم بادشاه حرب على عرش يرقَنْد. وفي أكتوبر من العام نفسه، اغتيل يَيا خوجة على يد خانيم بادشاه، وتعرّض أبناؤه وأتباعه لمذبحة، غير أن أحد أبنائه، ويدعى محمد (瑪罕木特، ويعرف أيضًا باسم أحمد 阿哈瑪特)، نجا بعد أن أُخفي في كهف. وفي عهد حكم تسِيوانغ أَرابْتَن (策妄阿拉布坦) على منطقة جنوب تيانشان، نُقل محمد إلى منطقة قريبة من إيلي وسُجن في أَرِينخابيرغا. وقد أنجب محمد ولدين هما: برهان الدين وخواجة جاهان، المعروفين لاحقًا باسم الأخوين الخوجة الأكبر والأصغر، اللذين قادا ثورة الكبير والصغير من آل خوجة الشهيرة في تركستان الشرقية.
نسب العائلة
الجد: محمد يوسف خواجة
الأب: آفاق خواجة
الابن: محمود (أو أحمد)
الأحفاد: برهان الدين وخوجة جهان
حفيده الأكبر (ابن الحفيد): سمسك