اندلع القتال بين قوات الولايات المتحدة وقوات جمهورية الفلبين في 4 فبراير عام 1899، فيما أصبح يعرف باسم معركة مانيلا عام 1899. في 2 يونيو عام 1899، أعلنت جمهورية الفلبين الأولى الحرب رسميًا ضد الولايات المتحدة. انتهت الحرب رسميًا في 2 يوليو 1902 بانتصار الولايات المتحدة. ومع ذلك، استمرت بعض الجماعات الفلبينية - بقيادة قدامى المحاربين في كاتيبونان، وهو مجتمع ثوري فلبيني - في محاربة القوات الأمريكية لعدة سنوات أخرى. كان من بين هؤلاء القادة الجنرال ماكاريو ساكاي، وهو عضو مخضرم في كاتيبونان تولى رئاسة جمهورية تاغالوغ المعلنة، التي تشكلت عام 1902 بعد القبض على الرئيس إميليو أغينالدو. واصلت مجموعات أخرى، بما في ذلك شعوب مورو والبيكولانو وبولاهان، الأعمال العدائية مثل تمرد شعب مورو في المناطق والجزر النائية، حتى هزيمتهم النهائية في معركة بود باجساك في 15 يونيو عام 1913.
خلال الحرب، شنّ جيش الولايات المتحدة تسع حملات عسكرية. تم تنظيم حملتين إضافيتين بعد النهاية الرسمية للحرب في 4 يوليو عام 1902 فيما يتعلق بتمرد شعب مورو، الذي استمر حتى عام 1913. حدثت بعض الأحداث الهامة الأخرى خارج نطاق الحملات المنظمة، سواء خلال الحرب نفسها أو في فترة ما بعد الحرب.