تشكلت حكومة يوسف زعين الثانية في 1 آذار 1966 بموجب المرسوم رقم 1 الصادر بتاريخ 1 آذار 1966 القاضي بتشكيل حكومة الجمهورية العربية السورية برئاسة الدكتور يوسف زعين واستمرت حتى 28 تشرين الأول 1968. نصت المادة الثانية من المرسوم على أن يتولى اللواء حافظ الأسد قائد القوى الجوية اختصاصات وسلطات وزير الدفاع إضافة إلى عمله.
هذه الحكومة هي الوزارة رقم 74 منذ استقلال سورية عن الدولة العثمانية عام 1918 والحكومة رقم 14 منذ الانفصال عن مصر.
عُدل اسم وزارة الأشغال العامة ليصبح وزارة الأشغال العامة والثروة المائية بموجب المرسوم رقم 11 لعام 1967